在本季《超級飛俠12》中，超級飛俠依然會接收來自世界各地小朋友的電話，為小朋友定制他們需要的特別的東西，并將東西送到他們手上。當小朋友們遇到困難，樂迪會請求總部的幫助，超級飛俠將帶來擁有各種屬性的愿望能量球，和小朋友們一起搖身一變成為酷炫的愿望守護者，陪同小朋友一起解決問題。而上一季新登場的三位超級飛俠新成員：恐龍飛機超級飛俠大壯、速食卡車超級飛俠糯糯、高速火車超級飛俠咚咚，也會在這一季中展示他們的過人之處。而當困難升級，超級基地也會變成超級機器人，跟超級飛俠一起陪小朋友們度過難關。
故事發生在長沙的一個奇妙的夜晚。夜貓子景為為（尹昉 飾）在書店邂逅了明早將要離開故鄉的何西西（張婧儀 飾），倆人相約搭伙夜游。何西西聊起同父異母的哥哥，脫口秀演員何岸（張藝興 飾），就在今晚的演出上，
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